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日本国と欧州連合との間で、医薬品に係る優良製造所基準（GMP）に関する分野別附属書を改正する外交上の公文が交換されたことにより、平成28年４月22日から、欧州連合側の権限のある当局がすべての欧州連合加盟国に拡大することを踏まえ、相互承認に関する日本国と欧州共同体との間の協定の運用が改められたもの。
なお、本通知の発出に伴い、「相互承認に関する日本国と欧州共同体との間の協定の運用について」（平成16年５月28日付け薬食監麻発第0528001号）及び「「相互承認に関する日本国と欧州共同体との間の協定の運用について」の一部改正について」（平成23年８月25日付け薬食監麻発0825第12号）は廃止された。
（平成30年７月18日付け薬生監麻発0718第１号により、一部改正あり。）
○関連通知
「英国との間で輸出入される医薬品の製造管理及び品質管理の取扱いについて」（令和元年９月20日付け薬生監麻発0920第２号）